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1985年原成都科技大學化工系創(chuàng)建了生物化學工程（生物化工）專業(yè)，于1986年開始招生，是全國首批具有該專業(yè)的院校之一。1990年開始培養(yǎng)研究生。1998年教育部進行本科專業(yè)調(diào)整，以生物化工專業(yè)為基礎(chǔ)，發(fā)展成生物工程專業(yè)。2001年由化工系并入新建立的制藥與生物工程系，建制為生物工程教研室和生物工程專業(yè)實驗室。本專業(yè)已擁具有1個博士后流動站，1個二級學科博士授權(quán)點、1個碩士授權(quán)點和1個工程碩士授權(quán)點，現(xiàn)有專職博士生導師5人，碩士生導師12人，在校碩博士生及工程碩士30余人。

研究方向：

• 生物產(chǎn)業(yè)化技術(shù)研究與開發(fā)

• 生物分離技術(shù)

• 生物發(fā)酵及基因工程

• 生物反應(yīng)器與膜技術(shù)

• 工業(yè)微生物與環(huán)境生物工程

• 可再生資源利用與開發(fā)

• 生物材料

主干課程：

高等生物化學、工業(yè)微生物學、環(huán)境微生物工程、微生物代謝調(diào)控、生物催化技術(shù)、生化反應(yīng)器及現(xiàn)代發(fā)酵工程、生物分離新技術(shù)、天然產(chǎn)物技術(shù)等。